עדויות נוספות מצביעות על כך שפנגולינים עברו את הקורונה מעטלפים לבני אדם

פנגולין הודי, Manis crassicaudata. (ויקי_צ'אוהאן/Getty Images)

פנגולינים , לא נחשים , עשוי להיות החוליה החסרה לשידור החדש נגיף קורונה מעטלפים ועד בני אדם.

מאז ההתפרצות הראשונית שלו בשוק הסיטונאי של מאכלי ים הואנאן בווהאן, סין, בסוף 2019, COVID-19 מאז הדביק יותר ממיליון אנשים ברחבי העולם. כדי להבין ולשלוט בהעברת COVID-19, מדענים דוהרים לחקור את נגיף הקורונה הגורם למחלה: SARS-CoV-2 , שנקרא בעבר 2019-nCoV.

SARS-CoV-2 הוא זואונוטי, מה שאומר שה נגיף מקורו בבעלי חיים וקפץ לבני אדם. אתגר קריטי הוא לקבוע איזו חיה העבירה את הנגיף לבני אדם.



אנחנו צוות של ביואינפורמטיקאים ואנו מרגישים שזו אחריותנו כלפי הקהילה העולמית לחקור את מקור הנגיף הזה.

מבוסס על המחקר במעבדה שלנו , אנחנו מאמינים שפנגולינים , בניגוד לנחשים , אולי שימשו כמארחים שהעבירו את נגיף הקורונה לאנשים וגרמו ל-COVID-19 המתמשך מגפה . הפנגולין, המכונה גם דוב נמלים קשקשי, הוא היונק הידוע היחיד עם קשקשים והוא נמצא באסיה ובאפריקה.

מסתורין של העברה זואונוטית

מאז ינואר 2020, הקונצנזוס הנוכחי בקרב הקהילה המדעית הוא זה SARS-CoV-2 מקורו בעטלפי פרסה ; עם זאת, אין זה סביר שעטלפים נתנו את הנגיף ישירות לבני אדם בהתבסס על מה שידוע על העברת נגיפים זואונוטיים קודמים.

במקום זאת, מדענים חשדו שנגיף העטלף הדביק בעל חיים אחר, 'מארח ביניים', שהעביר את הנגיף לאחר מכן לבני אדם.

לדוגמה, SARS-CoV, שהוא נגיף הקורונה שגרם למגפת תסמונת הנשימה החריפה (SARS) בשנת 2003, הוא קרוב משפחה של SARS-CoV-2. כמו כן, נמצא כי הוא הועבר מעטלפים למארח ביניים - סיבט דקל רעולי פנים - שהדביק לאחר מכן בני אדם.

באופן דומה, MERS-CoV, נגיף הקורונה שגרם לתסמונת הנשימה במזרח התיכון (MERS) בשנת 2012, קפץ מעטלפים למארח ביניים אחר, הגמל הדרומדרי , לפני הדבקה של בני אדם.

זהות מארח הביניים של SARS-CoV-2 היא אפוא תעלומה שחוקרים רבים מקווים לפתור, שכן הכרת מארח הביניים עוזרת מאוד למניעת התפשטות נוספת של מגפה .

א מחקר מוקדם טען שנחשים כמו הקריט הסיני והקוברה הסינית היו ככל הנראה מארחי הביניים של SARS-CoV-2. ובכל זאת, המסקנה הזו עורר במהירות ספקנות , בין השאר משום שלא קיימות עדויות קודמות לכך שנגיף קורונוב יכול לקפוץ מחיה בעלת דם קר, כמו נחשים, לבני אדם.

נחשים יוצרים מארח בלתי סביר

הטענה המוקדמת שנחשים מעבירים SARS-CoV-2 התבססה על ניתוח של הרצף הגנטי של הנגיף. לשניהם וירוסים ותאי בעלי חיים כדי לתפקד, יש לתרגם רצפים גנטיים (RNA או DNA) לחלבונים, אשר לאחר מכן מבצעים משימות רבות של הנגיף והתא.

חלבונים אלו קיימים כשרשראות מקושרות של חומצות אמינו בודדות; כל חומצת אמינו בחלבון מקודדת על ידי קבוצה של שלושה נוקלאוטידים, המכונה גם קודון, ברצף הגנטי.

מכיוון שישנם 64 קודונים שונים אפשריים אך רק 20 חומצות אמינו, מספר קודונים יכולים להתאים לאותה חומצת אמינו; לאורגניזמים שונים תהיה העדפה שונה עבור איזה קודון משמש לחומצת אמינו נתונה.

המחקר המוקדם הניח שכדי שנגיף הקורונה יגדל ביעילות בתוך תא חיה, העדפות השימוש בקודונים של נגיף הקורונה צריכות להתאים להעדפות של התא המארח.

החוקרים השוו את השימוש בקודונים בנגיף SARS-CoV-2 לעומת זה של התאים בשמונה בעלי חיים בשוק הסיטונאי של מאכלי ים של ווהאן הואנן. מחקר זה מצא שהנחשים חולקים את דפוס השימוש בקודון הדומה ביותר ל-SARS-CoV-2, ובכך הכריז שנחשים הם מארחי הביניים הסבירים ביותר.

עם זאת, ההשערה המרכזית שלהם לפיה נגיפים ומארחי בעלי החיים שלהם חולקים שימוש דומה בקודונים מעולם לא אומתה. הצוות שלנו באוניברסיטת מישיגן בחן את ההשערה הזו, וביצע ניתוח שיטתי יותר שפרסמנו ב מחקר מעקב אחרון .

השווינו את השימוש בקודונים של שלושה נגיפים (SARS-CoV-2, SARS-CoV ו-MERS-CoV) לאלו של יותר מ-10,000 סוגים שונים של בעלי חיים.

להפתעתנו, גילינו שהשימוש בקודון בנגיף הקורונה אינו נקבע על ידי המארחים שלו. לדוגמה, השימוש בקודונים של SARS-CoV ו-MERS-CoV קרוב הרבה יותר לצפרדעים ונחשים מאשר למארחי החיות האמיתיים שלהם (סיבטים וגמלים, בהתאמה).

זה מראה שלא ניתן להשתמש רק בשימוש בקודונים בתאי בעלי חיים כדי להסיק את המארחים של נגיפים, מה שמצביע על כך שהטענה המוקדמת של העברה נישאת בנחש של SARS-CoV-2 עשויה להיות שגויה.

גילוי הפנגולין כחוליה חסרה

מחקר המעקב שלנו מצא גם שהרצף הגנטי של נגיף הקורונה, שהתגלה ב דגימות ריאות של פנגולינים מלאים , היה דומה מאוד ל-SARS-CoV-2. שני הנגיפים חלקו 91 אחוז מהרצף הגנטי שלהם.

קיים דמיון חזק במיוחד בין חלבוני הספייק של שני הנגיפים הללו. חלבון הספייק, שנמצא על פני השטח של נגיף הקורונה, משמש את הנגיף כדי להיכנס לתא של בעלי חיים.

וירוס העטלף, שהיה האב הקדמון של SARS-CoV-2 , יש 19 חומצות אמינו על חלבון הספייק השונות מ-SARS-CoV-2; לנגיף הפנגולין יש רק חמש חומצות אמינו השונות מ-SARS-CoV-2.

בינתיים, כַּמָה קבוצות מחקר אחרות מצאו עדויות ניסיוניות נוספות לפנגולינים שנדבקו בנגיף הקורונהדומה מאוד ל-SARS-CoV-2.

בעוד שהפנגולינים הם כעת החשוד העליון שלנו כמארח הביניים, המחקר שלנו מסיק זאת עדיין יש לשקול מארחי ביניים פוטנציאליים אחרים .

נגיף קורונה יכול להשתמש ביותר מסוג אחד של בעלי חיים כדי להדביק בני אדם: למשל, בעוד שסיבטים ידועים בעיקר בהעברת SARS, בעלי חיים אחרים כמו כלבי דביבון וגיריות חמוס מסוגלים גם לשאת SARS .

באופן דומה, חתולים וחמוסים יכול להיות נגוע גם ב-SARS-CoV-2; עדיין לא ידוע אם בני אדם יכולים להידבק בנגיף הקורונה השוכן בתוך בעלי חיים אלה.

[ אתה צריך להבין את מגיפת הקורונה, ואנחנו יכולים לעזור. קרא את הניוזלטר של השיחה .]

יאנג ג'אנג , פרופסור לרפואה חישובית וביואינפורמטיקה, אוניברסיטת מישיגן ; צ'נגשין ג'אנג , מועמד לדוקטורט בביואינפורמטיקה, אוניברסיטת מישיגן , ו ווי ג'נג , פוסט דוקטורט לרפואה חישובית וביואינפורמטיקה, אוניברסיטת מישיגן .

מאמר זה פורסם מחדש מ השיחה תחת רישיון Creative Commons. קרא את ה מאמר מקורי .

אודותינו

פרסום עובדות עצמאיות ומוכחות של דיווחים על בריאות, מרחב, טבע, טכנולוגיה וסביבה.